La manga nos situa en la parte final de los acontecimientos acaecidos en KOF 95, con Kyo venciendo a Iori sin discursión en su primer combate. El Japan Team, compuesto por Kyo, Benimaru Nikaido y Goro Daimon se ha proclamado vencedor del torneo y se dispone a vencer al organiza...  La manga nos situa en la parte final de los acontecimientos acaecidos en KOF 95, con Kyo venciendo a Iori sin discursión en su primer combate. El Japan Team, compuesto por Kyo, Benimaru Nikaido y Goro Daimon se ha proclamado vencedor del torneo y se dispone a vencer al organizador, Rugal Bernstein, en el combate final. Saisyu Kusanagi, el padre de Kyo, está bajo el control de Rugal y deja fuera de combate sin muchas dificultades a Benimaru y Daimon, obligando a Kyo a enfrentarse a su propio padre. Kyo es más poderoso que su padre, y finalmente consigue liberarlo del control de Rugal. Rugal intenta eliminar a Kyo, pero no es rival para él. Con tal de vencerle, se transforma en Omega Rugal, utilizando el poder de Orochi, y después de un duro combate, es vencido por el Orochinagi de Kyo (su característico Desperate Move; una serpiente de llamas). El cuerpo de Rugal acaba siendo destruído por su propio exceso de poder Orochi. El protagonista, después de doblegar a Rugal, vuelve a su vida estudiantil (que es algo caótica, puesto que es altamente temido por los profesores), siendo acosado por Iori, que se quiere tomar la revancha de la derrota sufrida en el torneo. Personajes como Athena Asamiya o Sie Kensou entran en escena (Athena es la nueva alumna del instituto), además de Yuki, la novia de Kyo. Un nuevo y misterioso enemigo, de nombre Goenitz, está a punto de irrumpir en las vidas de Kyo e Iori.