Shin Seiki Evangerion: Ikari Shinji Ikusei Keikaku?, lit. 'Proyecto de crianza de Shinji Ikari') es un manga basado en el videojuego homónimo, segundo que ofrece una historia alternativa al universo de Evangelion, luego de la poca aceptación que Neon Genesis Evangelion: the Iron Maiden, tuvo entre los fanáticos, tanto por su calidad visual como en la trama de la misma. Producido por Gainax y siendo dibujado por el joven mangaka Takashi Osamu, presenta el mundo alternativo donde Shinji Ikari es feliz, basándose al igual que Iron Maiden 2nd en el último capítulo de la serie, en el cual Shinji imagina esa realidad diferente, los detalles de los dibujos son muchos más fieles a la serie original que Iron Maiden. El manga actualmente se está serializando en Japón en la revista Shonen Ace y tiene por el momento 10 volúmenes aunque está previsto que haya 12 volúmenes.