Ninja ... Ninja eran despiadados ... semidioses, gobernante de Japón con su karate en la edad de la tranquilidad ninja. Pero, algunos cometieron una forma prohibida de hara-kiri almacenar sus almas en el templo de Kinkaku para la futura resurrección. Su historia perdida fue falsificada y ocultó y la verdad sobre estos ninjas fue largo el olvido. Ahora, en el futuro en el que la universalización de la tecnología cynbernetic y redes electrónicas son Dios, de repente, las almas de ninja siniestros, resucitado de entre miles de años pasado se desataron en las sombras oscuras de Neo-Saitama. Fujikido Kenji, es un asalariado cuya esposa e hijo fueron asesinados en una guerra territorial ninja. En un encuentro con su propia muerte, Fujikido está poseído por un alma ninjas enigmática. Fujikido engaña muerte y se convierte en Ninja Asesino. Un Parca destinada para matar el mal ninja, comprometido con una guerra personal de venganza. Situado en los bajos fondos distópica de Neo-Saitama, Ninja Asesino adquiere ninjas Soukai Syndicate en un combate mortal.