Matsuri Kazamaki es un chico perteneciente a un Clan de NinjasExorcistas; el Clan Kazamaki, y es heredero de dicho Clan por parte de su abuelo. Los clanes de NinjaExorcistas se encargan de exorcizar a unas criaturas llamadas AYAKASHI, que son invisibles al ojo humano, y solo las pueden apreciar unas pocas personas especificas, pero que pueden causar disturbios y destrucción a su paso. Por otro lado, Suzu Kanade, la amiga de la infancia de Matsuri, por alguna razón también puede ver a los Ayakashi y de hecho, le gusta mucho jugar con ellos, aunque muchas veces termine metida en riesgos por confiar demasiado en ellos. Por eso Matsuri es quién se encarga de protegerla siempre de los problemas en los que se mete por culpa de confiar ciegamente en los Ayakashi. Un día, Suzu se encuentra con un Gato Ayakashi y empieza a jugar con él, hasta que ella y Matsuri se pelean porque a él no le gusta que juegue sin cuidado. Más tarde, el Gato Ayakashi se revela como Shirogane, el Soberano Ayakashi, quién quiere devorar a Suzu por ser una Sacerdotisa Ayakashi, y por lo tanto, un manjar para él. Hasta que es salvada por Matsuri y éste sella los poderes de Shirogane en un pergamino, haciendo que este último no pueda usar a pleno su poder. No sin antes lanzarle una Técnica Cambia-Género a Matsuri, por lo que éste se transforma en una chica. A partir de ahora, la misión de Matsuri y Suzu será que Shirogane revierta la técnica, para que Matsuri pueda volver a ser un chico.